Indkøb af 2 stk. NextSeq 1000 sekventeringsinstrumenter med tilhørende serviceaftale og kits til BPS (1)

(0) I afdelingen for bakterier, parasitter og svampe (BPS) på Statens Serum Institut (SSI) anvendes DNA sekventering som en fundamental hjørnesten i overvågningen af smitsomme mikroorganismer i Danmark. I afdelingen sekventeres hvert år >10.000 bakterieisolater mhp. at opklare fødevarebårne udbrud og mindske spredning af resistente microorganismer på hospitaler og i samfundet. Derudover sekventeres op mod 5000 mikrobiomprøver om året som en del af forskningsprojekter der ofte udføres i samarbejde med hospitaler og andre forskningsinstitutioner ligesom vi i afdelingen løbende har udviklet nye NGS analyser til specifikke formål. De fleste analyser udføres på dedikerede pipetteringsrobotter og analyseres hovedsageligt med Illuminas sekventeringsteknologi via et velfungerende og gennemtestet NGS setup. De nuværende sekventeringsinstrumenter, NextSeq550 og MiSeq, skal udskiftes til tilsvarende men samtidig tidssvarerne teknologi. Adskillige forbedringer i kemi og teknologi er blevet udviklet siden NextSeq550 og MiSeq kom frem.